Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC113Q9H0I3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC113Q9H0I3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC113Q9H0I3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC113Q9H0I3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC113Q9H0I3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC113Q9H0I3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms