Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM39BQ9GZU3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms