Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms