Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP44Q9C0F1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms