Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRCC1Q9C099 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms