Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms