Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC3Q9BY71 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC3Q9BY71 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms