Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNG6Q9BXT2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms