Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAIPQ9BWF2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAIPQ9BWF2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms