Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC2P3Q9BVR0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC2P3Q9BVR0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms