Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C16orf70Q9BSU1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms