Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM2D3Q9BRN9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms