Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MXRA8Q9BRK3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
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