Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TUBA1CQ9BQE3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA1CQ9BQE3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms