Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms