Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms