Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GABRG3Q99928 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRG3Q99928 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GABRG3Q99928 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRG3Q99928 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRG3Q99928 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRG3Q99928 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRG3Q99928 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRG3Q99928 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRG3Q99928 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRG3Q99928 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRG3Q99928 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRG3Q99928 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRG3Q99928 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRG3Q99928 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRG3Q99928 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRG3Q99928 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRG3Q99928 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRG3Q99928 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRG3Q99928 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRG3Q99928 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRG3Q99928 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRG3Q99928 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRG3Q99928 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRG3Q99928 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRG3Q99928 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRG3Q99928 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRG3Q99928 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRG3Q99928 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRG3Q99928 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRG3Q99928 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRG3Q99928 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRG3Q99928 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABRG3Q99928 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRG3Q99928 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRG3Q99928 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRG3Q99928 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRG3Q99928 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRG3Q99928 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRG3Q99928 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRG3Q99928 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRG3Q99928 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms