Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms