Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms