Protein–RNA interactions for Protein: Q96S96

PEBP4, Phosphatidylethanolamine-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEBP4Q96S96 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEBP4Q96S96 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms