Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP1Q96S65 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms