Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

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Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX1Q96RV3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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