Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMG1Q96Q15 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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