Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms