Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD6Q96NK8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms