Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms