Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC43Q96MW1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms