Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM20AQ96MK3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM20AQ96MK3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM20AQ96MK3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM20AQ96MK3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM20AQ96MK3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM20AQ96MK3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM20AQ96MK3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM20AQ96MK3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM20AQ96MK3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM20AQ96MK3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM20AQ96MK3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM20AQ96MK3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms