Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMTD1Q96MG8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms