Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q96MF0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q96MF0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q96MF0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q96MF0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q96MF0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q96MF0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q96MF0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q96MF0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q96MF0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q96MF0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q96MF0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q96MF0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q96MF0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q96MF0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q96MF0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q96MF0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Q96MF0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q96MF0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q96MF0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Q96MF0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q96MF0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q96MF0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q96MF0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms