Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms