Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms