Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC12Q96J65 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms