Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
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