Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SGSM3Q96HU1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM3Q96HU1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM3Q96HU1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM3Q96HU1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM3Q96HU1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM3Q96HU1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM3Q96HU1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM3Q96HU1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM3Q96HU1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM3Q96HU1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM3Q96HU1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM3Q96HU1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGSM3Q96HU1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms