Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms