Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms