Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms