Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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