Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms