Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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