Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAF2Q96CS3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms