Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCC1Q96CN9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms