Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms