Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNRQ92752 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNRQ92752 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNRQ92752 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
TNRQ92752 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNRQ92752 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNRQ92752 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
TNRQ92752 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNRQ92752 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNRQ92752 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNRQ92752 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNRQ92752 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNRQ92752 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNRQ92752 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNRQ92752 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNRQ92752 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNRQ92752 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNRQ92752 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNRQ92752 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNRQ92752 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNRQ92752 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNRQ92752 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNRQ92752 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNRQ92752 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNRQ92752 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNRQ92752 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNRQ92752 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNRQ92752 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNRQ92752 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNRQ92752 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNRQ92752 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNRQ92752 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNRQ92752 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNRQ92752 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNRQ92752 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNRQ92752 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNRQ92752 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNRQ92752 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNRQ92752 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNRQ92752 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
TNRQ92752 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
TNRQ92752 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNRQ92752 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNRQ92752 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNRQ92752 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNRQ92752 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNRQ92752 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNRQ92752 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNRQ92752 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNRQ92752 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
TNRQ92752 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
TNRQ92752 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNRQ92752 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNRQ92752 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNRQ92752 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
TNRQ92752 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNRQ92752 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNRQ92752 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNRQ92752 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
TNRQ92752 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNRQ92752 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNRQ92752 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNRQ92752 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNRQ92752 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
TNRQ92752 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNRQ92752 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TNRQ92752 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TNRQ92752 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TNRQ92752 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TNRQ92752 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TNRQ92752 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TNRQ92752 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TNRQ92752 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TNRQ92752 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TNRQ92752 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TNRQ92752 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TNRQ92752 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TNRQ92752 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TNRQ92752 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TNRQ92752 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
TNRQ92752 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TNRQ92752 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNRQ92752 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNRQ92752 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNRQ92752 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNRQ92752 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNRQ92752 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNRQ92752 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNRQ92752 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNRQ92752 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNRQ92752 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNRQ92752 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNRQ92752 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNRQ92752 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNRQ92752 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNRQ92752 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNRQ92752 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNRQ92752 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNRQ92752 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNRQ92752 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms