Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN9Q8WX39 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN9Q8WX39 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms