Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms