Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC107Q8WV48 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms