Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms