Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L4Q8WU68 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms